Zróżnicowane źródła zakażenia C. difficile zidentyfikowane w sekwencjonowaniu całego genomu AD 11

Jednak powolna lub zatrzymana ewolucja zarodników oznaczałaby, że genetycznie odmienne przypadki były jeszcze bardziej odległe. Genetyczne spory mogą także skomplikować próby rekonstrukcji zdarzeń transmisyjnych, ponieważ powiązane przypadki mogą być rozdzielone długimi przerwami. Jednakże takie rozdzielanie było rzadkie, a nieodróżnialne szczepy rozdzielone co najmniej o rok stwierdzono tylko w 12 z 785 próbek uzyskanych po pierwszym roku badania. Mieliśmy zaklasyfikowane mieszane infekcje, które zostały wykryte przez genotypowanie próbek pobranych od pacjentów, dla których dostępnych było wiele próbek.16 Jednak niezauważone mieszane infekcje, które zostały pominięte przez sekwencjonowanie pojedynczej subkultury kolonii i kolejne reinfekcje z tego samego typu sekwencji, mogą stanowić wyjaśnienie dla niektórych próbek. najwyraźniej niepołączone przypadki. Powszechnie występująca częstość zakażeń mieszanych (<10%) 16 nie mogła wyjaśnić różnorodności, która została zidentyfikowana, a szczepy mniejszościowe w mieszanych zakażeniach wydają się odgrywać ograniczoną rolę w przekazywaniu. 37 Próbki od bezobjawowych dorosłych 25, 38-40 i dzieci 41,42 i ze środowiska .8,24 nie były dostępne, więc nie mogliśmy ocenić tych potencjalnych źródeł transmisji. Kwantyfikacja ich udziału w całkowitej częstości infekcji C. difficile pozostaje obszarem do dalszych badań. Podsumowując, stwierdziliśmy, że przeniesienie zakażenia C. difficile od pacjentów z objawami stanowiło nieco ponad jedną trzecią takich przypadków w regionie o typowej częstości występowania infekcji, 21 co sugeruje, że wiele przypadków wynika z genetycznie zróżnicowanych źródeł. Zastosowanie szybkiego sekwencjonowania w trybie benchtop pozwala na identyfikację genetycznie powiązanych przypadków w czasie prawie rzeczywistym43, tak aby można było ukierunkować przypadki, które są wyraźnie powiązane ze szpitalem lub kontaktem ze społecznością, aby zapobiec dalszemu rozprzestrzenianiu się. Takie sekwencjonowanie pozwala również na bardziej wnikliwe monitorowanie instytucjonalnych wyników kontroli infekcji poprzez liczenie genetycznie powiązanych przypadków, a nie we wszystkich przypadkach. Dane z sekwencjonowania całego genomu są również wystarczająco dyskryminujące, że genetycznie powiązane przypadki bez wyraźnego powiązania epidemiologicznego można badać w wysoce skoncentrowany sposób, aby odkryć nowe drogi transmisji. Takie badania prawdopodobnie rzucają nowe światło na źródło obecnie niewyjaśnionych infekcji i różnych źródeł infekcji C. difficile.
[przypisy: stomatolog płock, dentysta Kraków, Gabinet Stomatologiczny ]

Tags: , ,

Comments are closed.

Powiązane tematy z artykułem: dentysta Kraków Gabinet Stomatologiczny stomatolog płock