Zróżnicowane źródła zakażenia C. difficile zidentyfikowane w sekwencjonowaniu całego genomu AD 6

Transmisja pośredniczona przez pracowników służby zdrowia jest prawdopodobnie uwzględniona w 17 genetycznie powiązanych próbkach (5%) uzyskanych od pacjentów z lekarzami z tej samej specjalności medycznej, którzy byli już wykluczeni ze 120 przypadków. Spośród 120 próbek, 32 (27%) uzyskano od pacjentów z możliwą transmisją od pośredniego pacjenta, który był ujemnie testowany na C. difficile w teście immunoenzymatycznym, ale który znał kontakt z objawowym pacjentem z genetycznie pokrewnym szczepem. Jednak 27 z 120 dopasowanych pod względem daty par genetycznie odmiennych (> 10 SNV) przypadków (22%) miało również co najmniej jeden wspólny kontakt, który miał negatywny wynik w teście immunoenzymatycznym, co sugeruje, że wiele pośrednich kontaktów, które znaleziono pomiędzy przypadkami genetycznie powiązanymi były wynikiem przypadku, a nie transmisji (P = 0,55). Podobnie, 36 pacjentów (30%) miało kontakt ze szpitalem, którzy nie byli testowani za pomocą testu immunoenzymatycznego (tj. Możliwego bezobjawowego nosiciela), podobnie jak w przypadku genetycznie powiązanych, w porównaniu z 35 parami genetycznie odmiennych przypadków (29%). ) (P = 1,00). Spośród tych 36 pacjentów, 32 miało również kontakt z enzymatycznym testem immunologicznym-ujemnym. Analizy, które pozwoliły na nieograniczony czas trwania skażenia oddziału (w celu uwzględnienia możliwego utrzymywania się zarodników na oddziałach) stanowiły dodatkowe 13 przypadków (11%). Żadna para pacjentów, którzy mieli 2 SNV lub mniej, nie uczestniczyła w tej samej przychodni tego samego dnia. Ogólnie rzecz biorąc, żadna z tych potencjalnych dróg przenoszenia nie mogła powiązać 48 pacjentów z genetycznie pokrewnymi szczepami, którzy nie mieli kontaktu ze szpitalem lub społecznością (40%). Sekwencjonowanie całego genomu a konwencjonalne genotypowanie
Rysunek 2. Rysunek 2. Liczba SNV między przypadkami na podstawie typowania sekwencji wielokrotnych i danych epidemiologicznych. Przedstawiono podział 957 izolatów uzyskanych od pacjentów z zakażeniem C. difficile od kwietnia 2008 r., Do 31 marca 2011 r. Pacjenci, u których występuje typ sekwencji i kontakt epidemiologiczny z przypadkiem od września 2007 r., Pokazano w Panelu A przez E: bezpośredni kontakt w oddziale (panel A), kontakt w szpitalu ze wspólną specjalizacją medyczną (panel B), kontakt w szpitalu bez wspólnej specjalności medycznej (panel C), kontakt tylko z kontaktem z chorobą siwą (panel D) i zanieczyszczenie skażone i kontakt z całym szpitalem (panel E). Pacjenci, u których wcześniej nie wystąpił przypadek szpitalny lub kontakt z przypadkiem tego samego typu, pokazano w Panelu F.10. Dla wielu kontaktów tego samego typu, które wystąpiły w różnych potencjalnych źródłach infekcji, najmniejsza liczba SNV związanych z tym rodzajem kontakt jest pokazany.
Jak opisano powyżej, zaklasyfikowaliśmy przypadki stosując sekwencje genetyczne, a następnie ustaliliśmy zależności epidemiologiczne
[hasła pokrewne: kaletki maziowe, rzucawka porodowa, cysta naskórkowa ]

Tags: , ,

Comments are closed.

Powiązane tematy z artykułem: cysta naskórkowa kaletki maziowe rzucawka porodowa